การตั้งโรงเรียนยันตรศึกษาไม่ใช่เรื่องง่าย เนื่องจากต้องอาศัยผู้เชี่ยวชาญ อีกทั้งต้องลงทุนสูงในด้านเครื่องจักรเครื่องมือ นอกจากนั้น ผู้เรียนก็ต้องผ่านการเลือกสรรมาในระดับหนึ่งในขณะที่นักเรียนมัธยมของประเทศยังมีจำนวนน้อยมากและบางโรงเรียนก็ไม่ได้สอนภาษาอังกฤษ การตั้งโรงเรียนยันตรศึกษาในโรงเรียนข้าราชการพลเรือนจึงทำได้ล่าช้ากว่าการตั้งโรงเรียนด้านอื่น
ปัญหาและการแก้ปัญหาเรื่องโรงเรียนยันตรศึกษาปรากฎในรายงานการประชุมสภาจัดการโรงเรียนข้าราชการพลเรือนของพระบาทสมเด็จพระจุลจอมเกล้าเจ้าอยู่หัว ครั้งที่ 12 เมื่อวันที่ 26 มกราคม 2457 สองปีก่อนสถาปนาจุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
รายละเอียดของการประชุม เผยให้เห็นการแก้ไขอุปสรรคต่างๆ นานาเพื่อให้สามารถผลิตผู้เรียนในสาขาวิชาเครื่องกลระดับประกาศนียบัตรได้จริงท่ามกลางความขาดแคลนต่างๆ